Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl12Q62401 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms