Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ss18Q62280 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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