Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5dQ62240 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5dQ62240 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5dQ62240 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5dQ62240 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5dQ62240 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5dQ62240 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Kdm5dQ62240 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm5dQ62240 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Kdm5dQ62240 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms