Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cd180Q62192 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd180Q62192 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms