Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SnrpaQ62189 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms