Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd47Q61735 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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