Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tfap2bQ61313 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms