Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms