Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms