Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stxbp3Q60770 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stxbp3Q60770 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms