Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mkrn3Q60764 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms