Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms