Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms