Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema5bQ60519 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms