Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms