Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr1Q5SWD9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms