Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r196Q5SVD5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r196Q5SVD5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r196Q5SVD5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r196Q5SVD5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmn1r196Q5SVD5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmn1r196Q5SVD5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r196Q5SVD5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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