Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Utp18Q5SSI6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms