Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Taf3Q5HZG4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Taf3Q5HZG4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Taf3Q5HZG4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Taf3Q5HZG4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Taf3Q5HZG4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Taf3Q5HZG4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Taf3Q5HZG4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf3Q5HZG4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms