Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ecm2Q5FW85 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms