Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nlrc3Q5DU56 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nlrc3Q5DU56 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nlrc3Q5DU56 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nlrc3Q5DU56 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Nlrc3Q5DU56 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nlrc3Q5DU56 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms