Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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