Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spire1Q52KF3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms