Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc47Q505F5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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