Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms