Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm5935Q497S0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5935Q497S0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms