Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacs2Q3V3Q7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms