Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ckap2Q3V1H1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms