Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BC051142Q3V0M8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BC051142Q3V0M8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BC051142Q3V0M8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC051142Q3V0M8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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