Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms