Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3V0E1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3V0E1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3V0E1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3V0E1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3V0E1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3V0E1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms