Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap1Q3UUV5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms