Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fchsd2Q3USJ8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms