Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem253Q3UNB8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms