Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrrc58Q3UGP9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc58Q3UGP9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lrrc58Q3UGP9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lrrc58Q3UGP9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lrrc58Q3UGP9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lrrc58Q3UGP9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lrrc58Q3UGP9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lrrc58Q3UGP9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc58Q3UGP9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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