Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zyg11bQ3UFS0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms