Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nom1Q3UFM5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms