Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LbrQ3U9G9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms