Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf166Q3U9F6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms