Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Q3U6N9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Q3U6N9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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