Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ulk3Q3U3Q1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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