Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Otud5Q3U2S4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Otud5Q3U2S4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Otud5Q3U2S4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Otud5Q3U2S4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Otud5Q3U2S4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Otud5Q3U2S4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms