Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Shcbp1lQ3TTP0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Shcbp1lQ3TTP0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Shcbp1lQ3TTP0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Shcbp1lQ3TTP0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Shcbp1lQ3TTP0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Shcbp1lQ3TTP0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Shcbp1lQ3TTP0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1lQ3TTP0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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