Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim43aQ3TL54 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms