Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca4Q3TKT4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca4Q3TKT4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca4Q3TKT4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.9 ms