Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp39Q3TIX9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp39Q3TIX9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms