Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cul4aQ3TCH7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul4aQ3TCH7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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