Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms