Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rtl9Q32KG4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl9Q32KG4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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