Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Col24a1Q30D77 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Col24a1Q30D77 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Col24a1Q30D77 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Col24a1Q30D77 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col24a1Q30D77 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms